《會痛的石頭》這首歌曲的歌詞含義是：石頭是被愛而不得的人所嚮往的愛情象徵，每當愛而不得時，就會想起那個石頭，也就會越來越嚮往那個不可能的愛情。因此，歌詞中的“會痛”指的是愛的痛了，也就是心痛了。
總的來說，《會痛的石頭》的歌詞含義表達了愛情中的遺憾和嚮往。