《科學超電磁砲S》的歌詞如下：
放學的鐘聲 響了起來
我們開始奔跑
這場無止盡的戰鬥
我總是無法獨力戰勝
這場戰鬥的開始與結束
總是有人相伴
不管是朋友或敵人
都是生命中的一部分
一直相信 勇氣和夢想
即使受到傷害 也不會消失
只要一直向前 無需迴頭
勇氣就是科學超電磁砲
在學校的生活總是充實
不管有沒有敵人
因為我們都是朋友
所以才能勇往直前
一直相信 勇氣和夢想
即使受到傷害 也不會消失
只要一直向前 無需迴頭
勇氣就是科學超電磁砲
無論何時 都會有幫手出現
我們將一起戰鬥到底
直到最後一刻 都不會放棄
勇氣就是科學超電磁砲
以上就是《科學超電磁砲S》的歌詞。