根據公開資料，《荷西與明鄭之歌》的歌詞作者不是固定的，不同的版本歌詞也不同。
例如，有網友創作的歌詞為：
男：荷西啊荷西 我的名字叫荷西
女：我跟你啊緣分不夠吧
男：你是台灣人 我是阿拉伯人
女：為什麼你要來台灣
男：因為台灣好 台灣好
女：我跟你啊沒結果
男：我愛你啊心不會變
女：我們注定不會在一起
男：為什麼我的心會痛
女：我曾經也愛過一個人
男：可是現在他不在了
女：我曾經也想過要嫁人
男：可是現在沒人要我了
男：為什麼我的心還在痛
女：因為愛過的人 永遠忘不了
男：荷西啊荷西 我要離開你
女：我會一直想你
也有音樂人翻唱的版本，例如《荷西與明鄭之歌》是朱習愛演唱的一首歌曲，歌詞部分表達了愛情的甜蜜與心酸，朱習愛的嗓音獨特，演唱的這首歌曲非常好聽。
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