《銀河鉄道999 exile》的歌詞含義是表達一個人在無盡的宇宙中的孤獨和迷茫，以及對未知的探索和追求。歌詞中的“exile”指的是流亡者，代表著一個人在宇宙中的無依無靠和孤獨無助。歌詞中的“星空に向かう旅路”、“たどり著く未來はどこに”等表達了對於未知的探索和追求，同時也表達了孤獨和迷茫的心情。整首歌的歌詞寓意著在宇宙中尋找自己的方向和歸宿，同時也表達了對於生命和存在的思考和探索。