四神丸的方歌是“四神丸子四般分，肉蔻五味與乾薑，棗肉辰砂為細末，溫胃澀腸最相宜”。
四神丸是治療脾腎陽虛泄瀉的基礎方，具有溫脾散寒、固腸止瀉的功效，常用於治療五更溏泄、腹痛腸鳴、不思飲食、或久痢不愈、或久崩不固等脾腎陽虛的病症。