《Yui Your Heaven》的歌詞含義是：表達了作者對Yui離開人世的不捨和悲痛，以及Yui所嚮往的天堂的美好。歌詞中“Yui, your heaven must be beautiful”表達了作者對Yui所嚮往的天堂的想像，暗示著天堂是美好的，沒有痛苦和悲傷。同時，“I'll wait for you under the endless sky”表達了作者對Yui的思念和等待，即使人已不在，也願意在無邊無際的天空下等待她。